花斑癣是由真菌引起的，而且仅寄生于皮肤角质浅层中，所以治疗起来并不困难，只要能杀灭真菌的药物都可以应用。

但是有些患者得病时间较长，皮肤上会留下白色的斑疹，这时即使应用再多再强烈的抗真菌药物也不能使其消退，这是为什么呢？
因为这些白斑是一种色素减退或色素脱失斑，是由于花斑癣菌所产生的一种特殊物质影响了皮肤的色素代谢，使黑色素的产生受到抑制的结果。花斑癣虽可在短期内治愈，但色素的恢复则需要很长时间。一般来说，如果不经特殊治疗，花斑癣遗留下来的色素减退斑要完全消退最少需要半年以上，长者可达数年至10余年。这主要决定于色素减退或脱失的程度和范围的大小，同时与个体差异有关。
虽然花斑癣引起的白斑与白癜风在机理和皮损表现上都不相同，但就局部而言不过是色素减少与完全消失的不同。治疗白癜风的药物能促进皮肤黑色素的产生，增加皮肤色素量，当然也可以用于花斑癣遗留的色素减退斑。常用的如30%～40%补骨脂酊及硫汞白癜风洗剂等均可使用。这主要是指遗留白色斑较明显者。如果花斑癣已治好，而遗留色素减退斑面积较小，颜色较淡者，完全可以不治疗。随着时间的延长，大部分患者能自行恢复。